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DNA fingerprinting --- Law and legislation

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From ABO typing during the first half of the 20th century, to the use of enzymes and protein contained in blood serums and finally direct DNA typing, biology has been serving forensic purposes for many decades. Statistics, in turn, has been constantly underpinning the discussions of the probative value of results of biological analyses, in particular when defendants could not be considered as excluded as potential sources because of different genetic traits. The marriage between genetics and statistics has never been an easy one, though, as is illustrated by fierce arguments that peaked in the so-called "DNA wars" in some American courtrooms in the mid-1990s. This controversy has contributed to a lively production of research and publications on various interpretative topics, such as the collection of relevant data, foundations in population genetics as well as theoretical and practical considerations in probability and statistics. Both DNA profiling as a technique and the associated statistical considerations are now widely accepted as robust, but this does not yet guarantee or imply a neat transition to their application in court. Indeed, statistical principles applied to results of forensic DNA profiling analyses are a necessary, yet not a sufficient preliminary requirement for the contextually meaningful use of DNA in the law. Ultimately, the appropriate use of DNA in the forensic context relies on inference, i.e. reasoning reasonably in the face of uncertainty. This is all the more challenging that such thought processes need to be adopted by stakeholders from various backgrounds and holding diverse interests. Although several topics of the DNA controversy have been settled over time, some others are still debated (such as the question of how to deal with the probability of error), while yet others - purportedly settled topics - saw some recent revivals (e.g., the question of how to deal with database searches). In addition, new challenging topics have emerged over the last decade, such as the analysis and interpretation of traces containing only low quantities of DNA where artefacts of varying nature may affect results. Both technical and interpretative research involving statistics thus represent areas where ongoing research is necessary, and where scholars from the natural sciences and the law should collaborate. The articles in this Research Topic thus aim to investigate, from an interdisciplinary perspective, the current understanding of the strengths and limitations of DNA profiling results in legal applications. This Research Topic accepts contributions in all frontiers article type categories and places an emphasis on topics with a multidisciplinary perspective that explore (while not being limited to) statistical genetics for forensic scientists, case studies and reports, evaluation and interpretation of forensic findings, communication of expert findings to laypersons, quantitative legal reasoning and fact-finding using probability.

Biology - General --- Biology --- Health & Biological Sciences --- probability theory --- interpretation --- Bacterial DNA --- Statistics and the law --- Forensic DNA profiling --- Low-template DNA analysis --- Commercialization --- DNA transfer --- forensic molecular biology

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Les cancers de la sphère oto-rhino-laryngologique (ORL) sont liés à la consommation de tabac et d’alcool. Depuis les années 80, des données cliniques ont mis en évidence un troisième facteur à risques, en établissant un lien entre une infection par le papillomavirus (HPV) et certains cancers de la sphère ORL. Lorsque l’on compare la survie des patients atteints d’un cancer de la sphère ORL infectés par un HPV (HVP+) et d’autres non infectés (HVP-), cinq ans après le traitement par chimio- et radiothérapie, les premiers présentent un taux nettement amélioré. La raison de cette différence n’a pas encore été établie. Récemment, il a été démontré, in vitro, que des cellules HPV+ issues de cancer ORL présentaient une sensibilité accrue à la radiothérapie. Ce mémoire s’inscrit dans un contexte qui cherche à comprendre pourquoi la survie des patients HPV positifs est nettement améliorée. Une raison pourrait être que les cellules HPV+ sont plus intrinsèquement plus radiosensibles, à cause de leur différence de profil biologique. L’immortalisation et la transformation des cellules infectées par un papillomavirus sont principalement dues à l’expression de ses oncoprotéines virales E6 et E7. Ces dernières ciblent respectivement les protéines suppresseurs de tumeurs p53 et pRb en les dégradant par ubiquitination. L’objectif de ce mémoire est d’investiguer l’implication des oncoprotéines virales E6 et E7 du papillomavirus humain dans la radiosensibilité accrue dans les cellules tumorales HPV positives, en produisant un modèle cellulaire HPV- qui exprime E6 et E7.Afin de créer un modèle cellulaire permettant d’étudier l’expression des deux oncoprotéines, l’ADN génomique de E6 et E7 a été cloné et transfecté dans une lignée cellulaire HPV négative : les HCT116. Il en existe deux souches : l’une est wild-type (WT) pour la protéine 53 alors que l’autre est déficiente pour cette même protéine (-/-). Deux lignées ont été créées pendant ce mémoire, les HCT116 WT E6 et HCT116 WT E7. Pour identifier l’impact des oncoprotéines, un test de clonogénicité a été effectué. Il y a une différence de sensibilité des cellules aux rayons ionisants en fonction du statut de la protéine p53 et de la transfection stable de l’oncoprotéine E7. Ensuite, le cycle cellulaire, la phosphorylation de l’histone H2AX (qui renseigne sur la proportion des lésions double brin) et le taux de réparation par recombinaison homologue et non homologue ont été analysés dans les différents types cellulaires. En conclusion, la différence de sensibilité des cellules transfectées par l’oncoprotéine E7 ne peut s’expliquer ni par l’arrêt en phase G2/M du cycle cellulaire, ni par la cinétique de déphosphorylation de γH2AX, ni par le taux de réparation par recombinaison non homologue.

Radiotherapy --- Otorhinolaryngologic Neoplasms --- DNA Probes, HPV

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Forensic sciences --- Evidence, Criminal --- DNA fingerprinting --- Criminal investigation --- Standards

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DNA fingerprinting --- Crime laboratories --- Law and legislation --- States --- Finance.