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Book
Développement de nouveaux outils pour l'analyse de la biogenèse et la fonction des micro-ARNs
Authors: --- ---
Year: 2015 Publisher: Bruxelles: UCL. Faculté de pharmacie et des sciences biomédicales,

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Abstract

ln this work , we aimed to develop novel tools for the analysis of function and biogenesis of micrq-RNAs . Since we worked on two different methods, this work is divided in two parts.The aim of the first part was to develop a quick, reliable and cheap method to synthesize and purify precursor-microRNAs (premiR). Our method is based on in vitro transcription by T7 RNA polymerase. To overcome limitations of this technique, we added special RNA structures (ribozymes) capable of cleaving the transcript in an autocatalytic manner and leaving only the desired premiR sequence. To be able to extract the ribozymes, which could interfere with further processing of the premiR, we added a second RNA structure (aptamer) capable of binding to an affinity matrix. Eventually, we were able to synthesize and purify different premiRs that could be cleaved by the enzyme Dicer.The second part of this thesis focused on the inhibition of micro-RNA. There already are different methods to inhibit them but they all suffer serious limitations. That's why we attempted to improve the method of the so-called micro-RNA sponges. These are transcr ipt containing many binding sites for a miR. These transcripts act as compet itive inhibitors by trapping the micro-RNA. However, these sponges are far from efficient due to the destabilization caused by the binding of the micro-RNA. This destabilization is caused by the decapping and deadenylation of the transcript. We therefore proposed that, if we were able to produce circular sponges these would probably be more stable and hopefully more efficient. To explore this hypothesis, we first tried to find a model allowing us to generate circular miRNA sponges. Three different experimental were generated and assessed for their capacity to generate circular sponge transcripts. Furthermore, we tested whether the best of the experimental systems could be integrated into a lentiviral vector that would allow us to infect a variety of cells.Future work will have to demonstrate whether the generated circular sponges are more efficient inhibitors of miRNA function when compared to their linear counterparts . Au cours de ce mémoire, nous nous sommes intéressés au développement de nouveaux outils permettant l'analyse de la fonction et de la biogenèse des micro-ARNs . Dans cette optique, nous avons exploré deux méthodes différentes. Par conséquent , ce travail est scindé en deux parties.Le but de la première partie de ce mémoire était le développement d'une méthode de synthèse de micro-RNA précurseur (premiR). A insi, nous avons mis au point une méthode sur base de la transcription in vitro. Afin d'éviter certaines contraintes du point de vue de la séquence , nous avons flanqué le premiR d'une séquence ARN particulière (ribozyme) capable de cliver tout nucléotides supplémenta ire éventuels. Ensuite, afin d'être capable d'extraire ces séquences contaminantes, nous avons complémenté les ribozymes d'une seconde structure ARN (aptamères) capable de se lier avec une matrice d'affinité. Suite à la transcription in vitro et la purification du premiR, nous avons analysé le résultat par électrophorèse en gel de polyacrylamide dénaturant et « Northern Blot ». Nous avons pu démontrer l'efficacité de notre méthode à produire des premiR, les purifier ainsi que montrer l'utilité de ceux-ci comme outils pour étudier le clivage catalysé par Dicer.La seconde partie de ce mémoire se penche sur le développement d'une nouvelle méthode d'inhibition des miRs. En effet, malgré l'existence d'outils permettant leur inhibition, ceux-ci souffrent encore de nombreux désavantages . Nous avons donc tenté d'améliorer la méthode d'éponges à miR décr ite précédemment dans la littérature. Cependant, afin d'améliorer leur stabilité, nous avec tenté de produire des éponges circulaires. Pour cela nous avons complémenté notre construction de signaux d'épissage et de séquences répétitives nécessaires à la circularisation comme décrit dans la littérature. Après transfection de nos constructions plasmidiques, nous avons mesuré les niveaux d'ARN circulaires et linéaires à l'aide de PCR quantitative . Ensuite nous avons développé des vecteurs lentiviraux permettant l'intégration stable de ces constructions. De futures études devront démonter si le système ainsi développé présente des améliorations par rapport aux autres techniques.


Dissertation
Mise au point de systèmes de vectorisation d'ARN interférent à base de chitosane
Authors: --- ---
Year: 2010 Publisher: [S.l.]: [chez l'auteur],

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Abstract


Book
Le marathon du messager : Histoire des vaccins à ARN messager
Author:
Year: 2022 Publisher: Les Ulis : EDP Sciences,

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Abstract

« À l'heure où nous écrivons ces mots, une véritable course contre la montre est en train de se jouer tout autour du globe, dont les principaux protagonistes sont, d'un côté, le Sars-CoV-2 et, de l'autre, les chercheurs - et tout spécialement ceux spécialistes des vaccins à ARN messager. L'histoire de ces vaccins inédits est avant tout européenne, grâce aux travaux décisifs de chercheurs allemands et français, commencés dès 1993 et poursuivis jusqu'à nos jours. Contre la pensée unique ambiante, ces chercheurs ont en effet imposé un nouveau concept thérapeutique, en définissant les clés biotechnologiques qui allaient ouvrir la voie à la préparation de l'ARN messager thérapeutique dans la lutte contre les cancers et les infections virales. Toutefois, revues scientifiques et leaders d'opinion américains taisent cette vérité. En s'appuyant sur le succès incontestable des vaccins anti-Covid mis sur le marché par Pfizer et Moderna, ils donnent une vision clairement déformée de l'histoire de ces nouveaux vaccins. Face à cette manipulation - voire cette usurpation - il est grand temps que les Européens rétablissent la vérité, en rappelant le rôle essentiel qui a été le leur dans la mise au point des vaccins à ARN messager. C'est cela, et bien d'autres choses encore, que ce livre s'attache à nous faire découvrir, et toujours à partir de sources objectives. Parsemé de données captivantes et pimenté de dessins humoristiques, cet ouvrage s'adresse aux scientifiques comme au grand public. »--Quatrième de couverture.

Keywords

RNA, Messenger --- history.


Book
Quantification des ARNm de la survivine et de ses variants dans les cellules normales et tumorales. Etude de la méthylation du promoteur de la survivine
Authors: --- ---
Year: 2004 Publisher: Bruxelles: UCL,

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Abstract

Survivin is an anti-apoptotic protein that belongs to the IAPs (Inhibitor of Apoptosis Proteins) family and controls mitosis.
By alternative splicing, the survivin gene generates two variants : survivin 2B and survivin 3. According to the literature, surviving and its isoforms are strongly expressed during foetal development and also in tumor cells, but they are not expressed in healthy tissues except in thymus and placenta. It has been published that the surviving and its variants produce antigens recognized by cytolitic T lymphocytes that could be used in cancer immunotherapy.
The goal of this work was to measure by quantitative RT-PCR the level of expression of surviving and its variants in normal tissues, tumor lines and tumor clinical sample to evaluate the feasibility of an immunotherapy directed against antigens derived from surviving or its variants. Our results show a high level of expression of surviving and its isoforms in normal cells with a high mitotic index, a level of expression that is similar to that observed in tumor cells.
The second part of this work is an attempt to study the methylation of the promoter of the surviving gene. The methylation status of this promoter in healthy and tumor cells is debated in the literature. In order to clarify this point, we quantified transcripts of surviving and its isoforms in B and T lymphocytes before and after treatment with azadeoxycytidin, a demethylating agent. The results obtained did not allow us to conclude if the promoter was methylated or not in these cells La survivine est une protéine anti-apoptotique appartenant à la famille des IAPs (inhibitors of apoptosis proteins) et régulant la mitose. Grâce à un épissage alternatif, le gène de la survivine génère deux autres formes de la survivine : la survivine 2B et la survivine 3. Selon la littérature, la survivine et ses isoformes seraient fortement exprimées au cours du développement fœtal ainsi que dans les cellules des tissus sains. On a publié que la survivine et ses variantes produisent des antigènes reconnus par des lymphocytes T cytolytiques qui pourraient être utilisés en immunothérapie anti-tumorale.
L’objet de ce mémoire est de mesurer par RT-PDR quantitative le niveau d’expression de la survivine et de ses variants au sein des tissus normaux, des lignées tumorales et des échantillons cliniques de tumeurs pour évaluer les danger d’une immunothérapie dirigée contre les antigènes provenant de la survivine et de ses variants. Les résultats de cette étude montrent un haut niveau d’expression de la survivine et de ses isoformes dans les cellules normales à index mitotique élevé, un niveau d’expression qui est souvent comparable à celui des cellules tumorales.
Une seconde partie du mémoire est consacrée à l’étude de la méthylation du promoteur du gène de la survivine. En effet, l’état de méthylation du gène de la survivine dans les cellules saines et les cellules tumorales est controversé dans la littérature. Pour clarifier l’état de méthylation du promoteur, on a quantifié l’abondance des ARNm de la survivine et de ses isoformes dans des lymphocytes B et T avant et après traitement avec un agent déméthylant, l’azadéoxycytidine. Les résultats obtenus ne nous permettent pas de conclure que le promoteur et méthylé ou pas

Keywords

RNA, Messenger --- Methylation --- Cells


Book
Identification et caractérisation des RNA messagers de la thyroglubuline
Authors: --- ---
Year: 1977 Publisher: Bruxelles: UCL,

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Abstract


Book
La chimie quantique appliquée à l'étude du DNA et du RNA
Author:
Year: 1966 Publisher: Paris : Gauthier-Villars,

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Abstract

Keywords

RNA --- DNA --- ARN --- ADN


Book
Les molécules de la vie.
Author:
ISBN: 290291850X 9782902918508 Year: 1986 Publisher: Paris : Pour la Science,

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Abstract

La biologie de 1986 diffère totalement de celle d'il y a seulement dix ans. D'une part, de nouvelles techniques de recherche ont banalisé nombre d'expériences qui étaient autrefois hors de portée, même du biologiste le plus habile; d'autre part, la nouvelle biologie moléculaire a fait bien plus qu'étendre la gamme des techniques de laboratoire: elle a très rapidement établi les bases de l'industrie biotechnologique et, mieux encore, elle a changé notre compréhension des êtres vivants, de la bactérie à l'être humain.

Keywords

ADN --- DNA --- ARN --- RNA --- proteins --- Carbohydrates --- Lipids --- genes --- DNA. --- RNA.


Dissertation
Contribution à l'étude de la diversité des ARN satellites des cucumovirus et de leur rôle dans l'expression de la pathogenèse virale.
Author:
Year: 1981 Publisher: Gembloux : Faculté des Sciences Agronomiques. Laboratoire de Pathologie Végétale,

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Abstract


Book
Virologie générale et moléculaire
Authors: ---
ISBN: 270400305X Year: 1980 Publisher: Paris : Doin,

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Abstract

Keywords

Disease. --- DNA. --- Lysogeny --- Rna --- Virus


Book
Les RNA interférents vont-ils révolutionner la pharmacologie ?
Authors: --- ---
Year: 2014 Publisher: Bruxelles: UCL,

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Abstract

Since the discovery regarding interference phenomenon, 20 years ago, RNA interference became standard method to suppress a gene expression into in vitro tests. Nowadays, the point of interest lies in vivo studies. The RNAi could be used as strong tool in specific therapy going from viral infection to cancer, if only the RNAi would have a proper structure. The main obstacle to RNAi potential therapeutic action is due to a difficulty small interfering RNA (siRNA) at the level of its action in vivo. An effective delivery strategy of siRNA must consider some limitations: (i) poor stability, (ii) undesirable non-specific immune response, (iii) a distribution in non-targeted tissues. The development of such a strategy requires a careful understanding of all the mechanisms of action of RNAi, engineering developed to overcome barriers to the delivery of siRNA, the site of action, and finally a clinical trial. This analysis allows us to offer a perspective on the therapeutic use of siRNA in human.

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