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Interacciones intermoleculares de la proteína de membrana Arf*GTP con potasio y glicerol, componentes mayoritarios de la vinaza de caña de azúcar
Authors: --- ---
Year: 2018 Publisher: Colombia Universidad Santiago de Cali

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Abstract

La vinaza de caña de azúcar, al ser un residuo producido en altas cantidades derivado de los procesos industriales para la producción de Etanol, es una mezcla de compuestos que tiene una utilidad cíclica para matrices de suelos debido a su composición natural e industrial que recaen en las ventajas y desventajas de sus aplicaciones. El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar.


Book
Interacciones intermoleculares de la proteína de membrana Arf*GTP con potasio y glicerol, componentes mayoritarios de la vinaza de caña de azúcar
Authors: --- ---
Year: 2018 Publisher: Colombia Universidad Santiago de Cali

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Abstract

La vinaza de caña de azúcar, al ser un residuo producido en altas cantidades derivado de los procesos industriales para la producción de Etanol, es una mezcla de compuestos que tiene una utilidad cíclica para matrices de suelos debido a su composición natural e industrial que recaen en las ventajas y desventajas de sus aplicaciones. El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar.


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Interacciones intermoleculares de la proteína de membrana Arf*GTP con potasio y glicerol, componentes mayoritarios de la vinaza de caña de azúcar
Authors: --- ---
Year: 2018 Publisher: Colombia Universidad Santiago de Cali

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La vinaza de caña de azúcar, al ser un residuo producido en altas cantidades derivado de los procesos industriales para la producción de Etanol, es una mezcla de compuestos que tiene una utilidad cíclica para matrices de suelos debido a su composición natural e industrial que recaen en las ventajas y desventajas de sus aplicaciones. El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar.


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Communicating chemistry through social media
Authors: --- ---
ISBN: 0841232814 Year: 2018 Publisher: Washington, DC : American Chemical Society,

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Abstract


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Coulson and Richardson's chemical engineering.
Authors: --- --- ---
ISBN: 9780128097465 9780081010990 0128097469 0081010990 Year: 2018 Publisher: Amsterdam : Elsevier,

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Abstract

Coulson and Richardson's Chemical Engineering has been fully revised and updated to provide practitioners with an overview of chemical engineering. Each reference book provides clear explanations of theory and thorough coverage of practical applications, supported by case studies. A worldwide team of editors and contributors have pooled their experience in adding new content and revising the old. The authoritative style of the original volumes 1 to 3 has been retained, but the content has been brought up to date and altered to be more useful to practicing engineers. This complete reference to chemical engineering will support you throughout your career, as it covers every key chemical engineering topic. Coulson and Richardson's Chemical Engineering: Volume 1A: Fluid Flow: Fundamentals and Applications, seventh edition, covers momentum transfer (fluid flow) which is one of the three main transport processes of interest to chemical engineers


Book
Amyloid Proteins : Methods and Protocols
Authors: --- ---
ISBN: 1493978160 1493978152 Year: 2018 Publisher: New York, NY : Springer New York : Imprint: Humana,

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Abstract

This third edition volume expands on the previous editions with many new chapters that cover the latest techniques and topics that were not addressed in the previous volumes. The chapters in this book are divided into three parts: Part One covers in vitro assays that focus on a variety of amyloids and how to study these peptides and proteins. Part Two describes cell culture models and assays, and Part Three explores methods on how to extract amyloid from tissue, its detection, and its characterization in vitro or in vivo. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls. Cutting-edge and authoritative, Amyloid Proteins: Methods and Protocols, Third Edition is a valuable resource for both students and scientists who are new to the field, as well as experienced researchers who would like to progress their research with the latest available techniques.

Keywords

Biochemistry. --- Protein Science. --- Biological chemistry --- Chemical composition of organisms --- Organisms --- Physiological chemistry --- Biology --- Chemistry --- Medical sciences --- Composition --- Amiloides --- Proteïnes --- Bioquímica --- Manuals de laboratori --- Química biològica --- Química fisiològica --- Biologia --- Medicina --- Química --- Absorció (Fisiologia) --- Anàlisi enzimàtica --- Biodegradació --- Biodisponibilitat --- Bioelectroquímica --- Bioenergètica --- Biogeoquímica --- Biologia molecular --- Bioquímica analítica --- Bioquímica clínica --- Bioquímica física --- Bioquímica quàntica --- Biosíntesi --- Centres actius (Bioquímica) --- Citoquímica --- Composició del cos humà --- Cromatografia --- Digestió --- Enginyeria bioquímica --- Enzimologia --- Equilibri àcid-base --- Fitoquímica --- Fixació de proteïnes --- Genètica bioquímica --- Immunoquímica --- Interfícies biològiques --- Lípids --- Lligands (Bioquímica) --- Marcadors bioquímics --- Metabolisme --- Minerals en l'organisme --- Neuroquímica --- Oxidació fisiològica --- Pigments (Biologia) --- Química biorgànica --- Química clínica --- Química microbiològica --- Quimiotaxi --- Quimiotaxonomia --- Toxicologia bioquímica --- Xenobiòtics --- Histoquímica --- Biomolècules --- Albúmines --- Apoproteïnes --- Conformació de proteïnes --- Enzims --- Factors de transcripció --- Glicoproteïnes --- Lipoproteïnes --- Nucleoproteïnes --- Pèptids --- Prions --- Protamines --- Proteïnes citosquelètiques --- Proteïnes de membrana --- Proteïnes de la sang --- Proteïnes recombinants --- Proteïnes supressores de tumors --- Receptors cel·lulars --- Ubiqüitina --- Xaperones moleculars --- Proteòmica --- Tècniques de laboratori --- Amiloide --- Substància amiloide --- Amiloïdosi


Book
Gangliosides : Methods and Protocols
Authors: ---
ISBN: 1493985523 1493985515 Year: 2018 Publisher: New York, NY : Springer New York : Imprint: Humana,

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Abstract

This detailed volume explores methods of examining gangliosides, membrane amphiphilic lipids that are deeply involved in the modulation of the overall properties of cellular membranes, as well as of the functions of membrane-associated proteins. The contents take into account the vital availability of new enzymatic approaches, the knowledge of an incredibly extensive number of glyco-enzymes, and the improvement of multi-genetic analyses. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls. Authoritative and practical, Gangliosides: Methods and Protocols serves as a valuable guidebook for entering in the vast research world of gangliosides.

Keywords

Biochemistry. --- Biochemistry, general. --- Biological chemistry --- Chemical composition of organisms --- Organisms --- Physiological chemistry --- Biology --- Chemistry --- Medical sciences --- Composition --- Lípids --- Bioquímica --- Manuals de laboratori --- Protocols clínics --- Plans d'actuació mèdica --- Protocols en medicina --- Protocols de diagnòstic clínic --- Protocols mèdics --- Protocols terapèutics --- Medicina clínica --- Històries clíniques --- Protocols d'infermeria --- Tècniques de laboratori --- Química biològica --- Química fisiològica --- Biologia --- Medicina --- Química --- Absorció (Fisiologia) --- Anàlisi enzimàtica --- Biodegradació --- Biodisponibilitat --- Bioelectroquímica --- Bioenergètica --- Biogeoquímica --- Biologia molecular --- Bioquímica analítica --- Bioquímica clínica --- Bioquímica física --- Bioquímica quàntica --- Biosíntesi --- Centres actius (Bioquímica) --- Citoquímica --- Composició del cos humà --- Cromatografia --- Digestió --- Enginyeria bioquímica --- Enzimologia --- Equilibri àcid-base --- Fitoquímica --- Fixació de proteïnes --- Genètica bioquímica --- Immunoquímica --- Interfícies biològiques --- Lligands (Bioquímica) --- Marcadors bioquímics --- Metabolisme --- Minerals en l'organisme --- Neuroquímica --- Oxidació fisiològica --- Pigments (Biologia) --- Química biorgànica --- Química clínica --- Química microbiològica --- Quimiotaxi --- Quimiotaxonomia --- Toxicologia bioquímica --- Xenobiòtics --- Histoquímica --- Lipoides --- Esfingolípids --- Fosfolípids --- Glicolípids --- Lípids de la sang --- Lipoproteïnes --- Membranes lipídiques --- Terpens --- Esteroides --- Metabolisme dels lípids


Book
Myelin : Methods and Protocols
Author:
ISBN: 1493978624 1493978616 Year: 2018 Publisher: New York, NY : Springer New York : Imprint: Humana,

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Abstract

This volume collects research methodologies for both basic and translational studies of myelin authored by experts in the field. Chapters in this book are divided into three parts: Part One focuses on visualizing myelin and studying it on a biochemical level; Part Two looks at cell culture systems used to uncover key mechanisms that regulate formation and maintenance of myelin; and Part Three discusses modeling disorders of myelin in both CNS and PNS, and therapeutic strategies for targeting these disorders. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls. Cutting-edge and comprehensive, Myelin: Methods and Protocols is a valuable resource for physiologists, molecular biologists, anatomists, cell and developmental biologists, and physician-scientists working in the field of myelin biology and the disorders associated with it.

Keywords

Biochemistry. --- Biochemistry, general. --- Biological chemistry --- Chemical composition of organisms --- Organisms --- Physiological chemistry --- Biology --- Chemistry --- Medical sciences --- Composition --- Mielina --- Bioquímica --- Manuals de laboratori --- Protocols clínics --- Plans d'actuació mèdica --- Protocols en medicina --- Protocols de diagnòstic clínic --- Protocols mèdics --- Protocols terapèutics --- Medicina clínica --- Històries clíniques --- Protocols d'infermeria --- Tècniques de laboratori --- Química biològica --- Química fisiològica --- Biologia --- Medicina --- Química --- Absorció (Fisiologia) --- Anàlisi enzimàtica --- Biodegradació --- Biodisponibilitat --- Bioelectroquímica --- Bioenergètica --- Biogeoquímica --- Biologia molecular --- Bioquímica analítica --- Bioquímica clínica --- Bioquímica física --- Bioquímica quàntica --- Biosíntesi --- Centres actius (Bioquímica) --- Citoquímica --- Composició del cos humà --- Cromatografia --- Digestió --- Enginyeria bioquímica --- Enzimologia --- Equilibri àcid-base --- Fitoquímica --- Fixació de proteïnes --- Genètica bioquímica --- Immunoquímica --- Interfícies biològiques --- Lípids --- Lligands (Bioquímica) --- Marcadors bioquímics --- Metabolisme --- Minerals en l'organisme --- Neuroquímica --- Oxidació fisiològica --- Pigments (Biologia) --- Química biorgànica --- Química clínica --- Química microbiològica --- Quimiotaxi --- Quimiotaxonomia --- Toxicologia bioquímica --- Xenobiòtics --- Histoquímica --- Beina de mielina --- Beina medul·lar (Teixit nerviós) --- Substància blanca de Schwann --- Lipoproteïnes --- Membranes cel·lulars


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Aguas del Iténez o Guaporé : Recursos hidrobiológicos de un patrimonio binacional (Bolivia y Brasil)
Authors: --- --- --- --- --- et al.
ISBN: 2709925370 9995425882 Year: 2018 Publisher: Marseille : IRD Éditions,

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Abstract

Bolivia y Brasil comparten una de las cuencas más atractivas y preservadas de la te-giuri amazônica: la cuenca del rio llénez o Guaporé, que escurre tanto sobre el lecho rocoso del Escudo Precámbrico Brasilefto como sobre las Hanuras del Beni. Estas influencias hacen que la cuenca del iténez tenga una elevada heterogeneidad de habitats, una fauna acuálica peculiar y un alto valor de conservation. Este patrimo­nio binacional posée un potencial importante para la conservación de la diversidad regional y cl dcsar rollo sostcniblc participativo de las comunidades locales. El libro contiene un resumen del conotimìento de la cuenca y sus recursos, generado en los últimos 10 anos por un equipo de investigadores bolivianos, brasilefios y de otras nacionalidades. Se presenta una descripeión del medio fisico, así como resultados relevantes sobre la biodiversidad acuática, con énfasis en algas, peces, reptiles y mamíferos. El aporte más notable del libro, adernas de la descripeión ecológica del ecosistema, son las lecciones aprendidas que surgieron de experiências locales sobre la élaboration participativa de herramientas para la gestion de los recursos hidrobiológicos. A Bolívia e o Brasil compartilham uma das bacias hidrográficas mais atrativas e preservadas da região amazônica: a bacia do Rio Iténez ou Guaporé. A combinação das influências do escudo pré-cambriano brasileiro e da planícies do Beni é uma das razões pela qual existem na região elevada heterogeneidade de habitats, fauna aquática peculiar e alto grau valor dc conservação. Eslc patrimônio binacional possui potencial significativo para a conservação da diversidade regional e desenvolvimento sustentável participativo das comunidades locais. O livro contém um resumo do conhecimento da bacia e seus recursos, gerado nos últimos dez anos por uma equipe de pesquisadores bolivianos, brasileiros e de outras nacionalidades. Apresentamos uma descrição do meio físico, bem como resultados relevantes da biodiversidade…


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Handbook of ELISPOT : Methods and Protocols
Author:
ISBN: 1493985671 1493985663 Year: 2018 Publisher: New York, NY : Springer New York : Imprint: Humana,

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Abstract

This third edition volume expands on the previous editions with new protocols and up-to-date techniques to help researchers excel in this field. The chapters in this book cover topics such as ELISpot’s sibling (FluoroSpot); ELISpot for influenza, Dengue virus, and tuberculosis; and vaccine research, essentials control, and assay evaluation in ELISpot. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls. Cutting-edge and comprehensive, Handbook of ELISPOT: Methods and Protocols, Third Edition is a valuable resource for both novice researchers and experienced ELISpot users.

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