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algue rouge

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Algae --- Algae --- Freshwater --- Freshwater --- Phaeophyceae --- Phaeophyceae --- Bacillariophyceae --- Bacillariophyceae --- Chrysophyceae --- Chrysophyceae --- taxonomy --- taxonomy --- Xanthophyceae --- Algue jaune --- Xanthophyceae --- Algue jaune

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Ce mémoire a été réalisé sous la supervision de Pierre Cardol au Laboratoire de Génétique et Physiologie des Microalgues à l'Université de Liège. L'objectif principal de cette étude était d'élucider les rôles de la chlorophylle b et de la protéine CP29 dans l'organisation, la structure et la fonction de l'appareil photosynthétique de l'eucaryote photosynthétique Euglena gracilis. Nous avons caractérisé des souches mutantes knock-out (KO) générées par CRISPR-Cas9, déficientes pour la protéine d'antenne CP29 du photosystème II, ainsi que pour les enzymes chlorophyllide a oxygénase (CAO) et divinyl réductase (DVR), qui jouent un rôle clé dans la voie de biosynthèse de la chlorophylle. Pour ce faire, une série d'expériences a été réalisée, incluant des tests de croissance de mutants sous diverses conditions lumineuses, afin d'évaluer spécifiquement leur tolérance à ces variations. Les résultats ont révélé que les mutants CP29 KO n'ont montré aucun défaut de croissance significatif, tandis que les mutants CAO KO et DVR KO ont été sévèrement affectés sous des conditions de lumière intense (475 μmol Photon m-2·s-1). L'analyse de la composition des pigments par chromatographie liquide à haute performance (HPLC) a confirmé l'inactivité des enzymes ciblées, entraînant une réduction marquée de la chlorophylle b et une diminution de la néoxanthine dans les souches CAO KO et DVR KO, ainsi que la présence exclusive de la divinyle chlorophylle a dans la souche DVR KO. De plus, l'analyse par spectrométrie de masse a confirmé l'absence de la protéine CP29 dans les mutants CP29 KO.
Une analyse biochimique supplémentaire, utilisant l'électrophorèse sur gel natif à haute résolution (hrCN-PAGE), a révélé des différences structurelles substantielles dans les photosystèmes des mutants. Dans les trois types de mutants, les bandes correspondant aux supercomplexes du PSII (SC-PSII) étaient absentes, et dans les mutants CAO KO et DVR KO, une perte spécifique des trimères LHCII3 a été observée. Ces altérations structurelles ont été corroborées par des analyses spectroscopiques in vivo, incluant la fluorescence à température ambiante et à 77K. De plus, les mutants CAO KO et DVR KO ont montré une diminution de l'efficacité des mécanismes de photoprotection (qT), tandis qu'une réduction du taux de transport d'électrons relatif (rETR) a été observée exclusivement chez les mutants DVR KO.
Dans l'ensemble, cette étude apporte des informations cruciales sur le rôle de la chlorophylle b et de la protéine CP29 dans l'intégrité structurelle et fonctionnelle de l'appareil photosynthétique d'Euglena gracilis, soulignant l'impact de ces composants sur l'efficacité de la collecte de lumière et la photoprotection.

micro-algue --- euglena gracilis --- photosynthèse --- Chlorophylle --- photosystèmes --- Sciences du vivant > Biochimie, biophysique & biologie moléculaire

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En mer Méditerranée, le renforcement des pressions anthropiques, les changements climatiques et l’augmentation des introductions d’espèces exotiques bouleversent la biodiversité du milieu marin. Ces divers phénomènes sont observables au niveau de la baie de Calvi en Corse. 
Parmi les espèces marines exotiques répertoriées en baie de Calvi (Corse), la prolifération de l’algue verte envahissante Caulerpa cylindracea est particulièrement préoccupante. En 2009, cette algue originaire d’Australie est recensée pour la première fois en baie de Calvi. Elle s’y développe rapidement et menace l’équilibre de l’écosystème en entrant en concurrence avec les espèces autochtones. La Caulerpe colonise divers substrats des fonds marins et tisse rapidement une épaisse couverture rendant de ce fait le substrat inaccessible aux autres organismes. 
Pour ces raisons, il est essentiel de réaliser un suivi de ces algues afin d’estimer l’ampleur de leur prolifération et leur impact sur le milieu. La réalisation de leur recensement a été effectuée en plongée bouteille ou lors de sorties en PMT en différents lieux de la baie entre 0 et 20 mètres de profondeur. Durant ces prospections, l’indice paysager ICAR basé sur 4 critères (substrat, superficie, couverture algale, expérience du plongeur) fut employé afin d’estimer l’ampleur de la colonisation de la Caulerpe. Les nombreuses mesures ont permis d’affiner cet indice et d’y associer un code couleur permettant de mieux visualiser l’ampleur et l’évolution temporelle de la colonisation. Des comptages de l’algue à l’aide de quadrats ont également été effectués en parallèle.
Tous les sites signalés comme impactés par la Caulerpe en 2012 le sont toujours en 2019, avec une progression nette de l’indice de colonisation sur l’ensemble des substrats. De plus, de nouveaux sites colonisés ont été découverts. Cette étude confirme aussi le fait que la densité de la couverture de l’algue augmente avec la profondeur. Il est probable que la présence observée de la Caulerpe à proximité de la surface soit un signe de sa présence aux profondeurs supérieures. D’autre part, la colonisation de la Caulerpe semble être favorisée par les activités anthropiques telles que l’ancrage, permettant notamment son installation sur des surfaces désormais rendues accessibles suite à l’arrachage de parties de l’herbier de posidonie.
Des changements de biodiversité s’opèrent en baie de Calvi suite notamment à l’arrivée et aux introductions de nouvelles espèces. Le recensement de ces espèces est un travail à long terme et de grande ampleur.

espèce exotique --- espèce invasive --- Caulerpa cylindracea --- algue --- Méditerranée --- filamenteuses --- caulerpe --- Calvi --- Sciences du vivant > Sciences aquatiques & océanologie

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Algae --- Algues --- Periodicals --- Périodiques --- Algologie. --- Algue. --- Algae. --- Japan. --- Earth Sciences --- Life Sciences --- Marine Geology and Oceanography --- Biology --- Botany --- duplicates available --- Japan --- current periodical --- phycology --- quarterly --- Algas --- Limu --- Nihon --- Nippon --- Iapōnia --- Zhāpān --- I︠A︡ponii︠a︡ --- Yapan --- Japon --- Japão --- Japam --- Mư̄ang Yīpun --- Prathēt Yīpun --- Yīpun --- Jih-pen --- Riben --- Cryptogams --- Phytoplankton --- Algology --- Government of Japan --- I͡Aponii͡ --- al-Yābān --- Giappone --- Japani --- Japonia --- Japonsko --- Japonya --- Nihonkoku --- Nippon-koku --- Nipponkoku --- State of Japan --- Yābān --- algen